Понедельник, 18 Февраль 2019 09:25

Изучение инфицированности рыжей полёвки вирусом Puumala в природных очагах ГЛПС Татарстана

Автор 
Оцените материал
(0 голосов)

УДК:616-022.39
1,2Трифонов В.А., 3Давидюк Ю.Н., 2,5Исаева Г.Ш., 2,3Решетникова И.Д., 2Савицкая Т.А., 2,4Волостнова Е.С.,2,4Гайнуллин А.А., 2,4Сафиуллина Г.Ш., 2Бойко В.А., 3Шамсутдинов А.Ф., 3Кабве Э., 3Мартынова Е.В., 3Исмагилова Р.К., 3,6Хайбуллина С.Ф., 3Ризванов А.А., 6Морзунов С.П.

1 КГМА – филиал ФГБОУ ДПО РМАНПО Минздрава России. 420012 г. Казань, ул. Бутлерова, д. 36.
2 ФБУН "Казанский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии" Роспотребнадзора. 420012 г. Казань, ул. Б.Красная, д. 67.
3 Казанский (Приволжский) федеральный университет. 420008 г. Казань, ул. Кремлёвская д.18.
4 ФБУЗ "Центр гигиены и эпидемиологии в Республике Татарстан (Татарстан)". 420061 г. Казань, ул. Сеченова д.13а.
5 ФГБОУ ВО "Казанский государственный медицинский университет" Минздрава России. 420012 г. Казань, ул. Бутлерова д. 49.
6 Университет штата Невада, г.Рино, США. 1664 N.Virginia St., Reno 89557, USA.

 

Изучение инфицированности рыжей полёвки вирусом Puumala в природных очагах ГЛПС Татарстана

 

Резюме. Актуальность проблемы. Ежегодно подавляющее большинство случаев геморрагической лихорадки с почечным синдромом (ГЛПС), регистрируется в Приволжском федеральном округе Российской Федерации, где уровень заболеваемости в среднем в 2 раза выше, чем в стране. В частности, высокий уровень заболеваемости ГЛПС наблюдается в Республике Татарстан (РТ). Так, в 2015-2017 гг. в РТ зарегистрировано от 474 до 1076 случаев заболевания. Возбудителем ГЛПС в РТ является вирус Puumala (PUUV) из рода Hantavirus, принадлежащем семейству Bunyaviridae. В природе вирус циркулирует в популяциях рыжей полёвки Myodes glareolus, где вызывает хроническую инфекцию. Заражение происходит в местах обитания рыжей полёвки, поэтому для принятия мер по снижению уровня заболеваемости важно знать, локализацию популяций грызунов инфицированных вирусом PUUV. Поэтому изучение уровня инфицированности популяций рыжей полёвки вирусом PUUV с высоким уровнем заболеваемости геморрагической лихорадки cпочечным синдромом очень актуально.

Ключевые слова: эпидемиология, заболеваемость, геморрагическая лихорадка, почечный синдром, хантавирусы, геновариант вируса Puumala.

Контактное лицо:

Савицкая Татьяна Александровна,
к.б.н., заведующая лабораторией ФБУН "Казанского научно-исследовательского института эпидемиологии
и микробиологии" Роспотребнадзора. Адрес: г.Казань, ул. Б.Красная д.67. Тел.: (843) 238-99-79
e-mail: Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.


1,2Trifonov V.A., 3Davidyuk Yu.N., 2,5Isaeva G.Sh., 2,3Reshetnikova I.D., 2Savitskaya T.A., 2,4Volostnova E.S., 2,4Gaynullin A.A., 2,4Safiullina G.Sh., 2Boyko V.A., 3Shamsutdinov A.F., 3Kabwe E., 3Martynova E.V., 3Ismagilova R.K.,3,6Haybullina S.F., 3Rizvanov A.A., 6Morzunov S.P.

1 Medical Academy of the Ministry of Health of Russia. 36 Butlerov St., Kazan 420012, Russia.
2 Kazan Research Institute of Epidemiology and Microbiology. 67 B. Krasnay St., Kazan 420012, Russia.
3 Kazan Federal University. 18 Kremlyovskaya St., Kazan 420008, Russia.
4 Center for Hygiene and Epidemiology in the Republic of Tatarstan. 13a Sechenova St., Kazan 420061, Russia.
5 Kazan State Medical University of the Ministry of Health of Russia. 49 Butlerova St., Kazan 420012, Russia.
6 University of Nevada, Reno, USA. 1664 N.Virginia St., Reno 89557, USA.

 

Study of the infection of the red vole by the Puumala virus in natural foci of HFRS in Tatarstan

 

Abstract. Introduction. Annually, the overwhelming majority of cases of hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS), is registered in the Volga Federal District of the Russian Federation, where the incidence rate is on average 2 times higher than in the country. In particular, the high incidence of HFRS is observed in the Republic of Tatarstan (RT), where 474 to 1076 cases were registered in 2015- 2017 years. The causative agent of HFRS in the RT is the Puumala virus (PUUV) from the genus Hantavirus, the family Bunyaviridae, whose natural reservoir is bankvole Myodesglareolus. Human become infected after close contact with carrier animal via inhaling virus contaminated aerosol, cleaning animal droppings or animal bites. Therefore, monitoring of animal infectivity and circulating strains of hantaviruses is essential to prevent infection and identify regions which are high risk of human infection.

Key words: epidemiology, incidence, hemorrhagic feve, renal syndrome, hantaviruses, genomovirus of Puumala virus.

Contact person:

Tatyana Savitskaya
Cand. Biol. Sci., Head Laboratory Natural Focal Infections, Kazan Research Institute of Epidemiology and
Microbiology Address: 67 B. Krasnaya St., 420012 Kazan, Russia. Phone: (843) 238-99-79,
e-mail: Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.


Введение. Ежегодно подавляющее большинство случаев геморрагической лихорадки с почечным синдромом (ГЛПС), регистрируется в Приволжском федеральном округе Российской Федерации, где уровень заболеваемости в среднем в 2 раза выше, чем в стране [1,2]. В частности, высокий уровень заболеваемости ГЛПС наблюдается в Республике Татарстан (РТ), где заболевание протекает в легкой форме. Так, в 2015- 2017 гг. в РТ зарегистрировано от 474 до 1076 случаев заболевания [2,3]. Одним из факторов, влияющих на активность эпизоотического процесса среди носителей возбудителя инфекции, являются ландшафтные особенности ареала их обитания. РТ расположена на востоке ВосточноЕвропейской равнины вдоль среднего течения реки Волги и нижнего течения реки Камы. Долинами этих рек территория республики делится на три физико-географических региона: Предволжье, Предкамье и Закамье [4]. Своеобразие территории РТ в ландшафтном отношении определяется ее географическим положением: на границе смены бореальной ландшафтной зоны на суббореальную северную семигумидную. Ландшафтное районирование РТ, проведенное методом математического моделирования с учетом геоморфологического районирования, карты почв, растительных формаций, типологического районирования позволило установить, что территория республики делится на две ландшафтные зоны (степная и лесостепная) и четыре подзоны: бореальная умеренно-континентальная (южнотаежная); бореальная умеренноконтинентальная (подтаежная); суббореальная северная семигумидная (широколиственная); суббореальная северная семигумидная (типичная и южная лесостепная) [5]. Наличие значительных различий в ландшафтных зонах определяет расселение мелких грызунов, которые более распространены в широколиственной и лесостепной зонах. Возбудителем ГЛПС в РТ является вирус Puumala (PUUV) принадлежащий роду Hantavirus, семейства Bunyaviridae. Природным резервуаром PUUV является рыжая полёвка Myodes glareolus [1,6]. Считается, что заражение человека происходит в местах обитания рыжей полёвки, поэтому, для принятия мер по снижению уровня заболеваемости, необходимо знать, какие из популяций грызуна наиболее инфицированы вирусом PUUV. На данный момент в литературе есть лишь единичные исследования уровня инфицированности грызунов хантавирусами в муниципальных образованиях РТ, что негативно влияет на проведение должных мероприятий по предотвращению инфицирования PUUV [7,8,9].

Цель. Оценка уровня инфицированности популяций рыжей полёвки вирусом PUUV в районах РТ, расположенных в различных ландшафтные зонах, для которых характерен высокий уровень заболеваемости ГЛПС.
Задачи исследования. Обнаружение хантавирусов Puumala (PUUV), Tula (TULV), Dobrava (DOBV) у особей рыжей полёвки из разных популяций в 2015-2017 гг. в 11 районах РТ.
Материалы и методы. Грызунов отлавливали в весенние-летние и осенние периоды 2015-2017 гг. в районах обитания рыжей полёвки вблизи от населённых пунктов одиннадцати районов РТ. Районы Лаишевский, Пестречинский, Зеленодольский, Мамадышский относятся к зоне Предкамья, субореальная северная семигумидная ландшафтная зона (широколиственная подзона), а Нижнекамский, Альметьевский, Тукаевский, Лениногорский, Мензелинский и Елабужский – к зоне Закамья, субореальная северная семигумидная ландшафтная зона (типичная и южная лесослепная подзона). В зоне Предволжья расположен один Верхнеуслонский район, который также относится к субореальной северной семигумидной ландшафтной зоне (типичная лесостепная подзона).
Выделение общей РНК из лёгочной ткани грызунов проводилось с использованием реагента Trizol (Invitrogen, США) согласно рекомендациям производителя. к ДНК синтезировали с помощью обратной транскриптазы Thermo Scientific Revert Aid Reverse Transcriptase (ThermoFisherScientific, США) по стандартной методике. кДНК служила матрицей для проведения ПЦР с использованием пар праймеров, специфичных для участков S- и М-сегментов PUUV, TULV и DOBV.
Полученные ПЦР-продукты секвенировали, используя 3730 DNA Analyzer (ABI, USA). Идентификацию хантавирусов проводили, сравнивая первичные нуклеотидные последовательности ПЦР-продуктов с последовательностями генома хантавирусов, размещёнными в базе данных GenBank, с помощью программы BLAST. Заболеваемость населения ГЛПС в изучаемых районах анализировалась на основе официальной статистической отчетности Управления Роспотребнадзора по Республике Татарстан.
Статистический анализ полученных данных проводился при помощи пакета статистических программ (MICROSOFT EXCEL for Windows).

Данные описательной статистики представляли в виде показателей и их ошибок репрезентативностих в виде p + m, где p – экстенсивный показатель, m – ошибка репрезентативности. Полученные значения считали достоверными при р < 0,05.
Результаты и обсуждение. Из 111 особей рыжей полёвки отловленных в 2015 г., методом ПЦР, вирусная РНК была обнаружена в 29 (26,1%) образцах. Наивысший уровень инфицированности, обнаружен в популяции Зеленодольского района, самый низкий – Пестречинского (Таблица 1). Высокий уровень инфицированности рыжей полёвки совпал по времени с высоким уровнем заболеваемости ГЛПС в РТ в 2015 г., превышающим средний многолетний показатель [10].
В образцах отловленных в 2016 г., вирусная РНК была обнаружена у 9 (7,6%) особей из 118 исследованных (Таблица 2). Максимальное значение инфицированности выявлено в Нижнекамском районе, в то время как в трёх из исследованных районов инфицированных особей не выявлено. В то же время уровень заболеваемости ГЛПС в 2016 г. снизился по сравнению с 2015 г. на 30%, с 28,3 до 20,1 на 100 тыс. населения [3].


В образцах отловленных в 2017 г. положительные результаты на содержание вирусной РНК были обнаружены у 14 (10,1%) особей рыжих полевок из 138 исследованных (Таблица 3). Максимальное значение показателя инфицированности
установлено в популяции грызунов в Тукаевском районе, в то же время в двух других районах зон Предкамья и Закамья (Зеленодольский и Елабужский районы, соответственно) инфицированных особей не выявлено. Исследования 367 образцов легочной ткани от рыжих полевок в 2015-2017 гг. на содержание хантавирусов TULV и DOBV показали отрицательный результат. В зоне Предкамья в 2015 г. доля инфицированных рыжих полевок составила 25,23+4,55%, а в зоне Закамья она была 30,0+10,20%. В 2016 г., доля инфицированных рыжих полевок уменьшилась, причем в зоне Предкамья положительных результатов не выявлено, а в зоне Закамья она составляла 12,12+4,01%. В 2017 г., в зоне Предкамья показатель инфицированности рыжих полевок составил 9,72+3,49%, а в зоне Закамья он составил 10,71+4,13%. Полученные результаты указывают на тенденцию к снижению доли инфицированных полевок за период наблюдения в Предкамье в 2,6 раза, а в Закамье в 2,8 раза.

В исследованиях, проведенных нами ранее, было установлено, что среднемноголетний уровень заболеваемости населения ГЛПС в зоне Предкамья составлял 6,5 на 100 тыс. населения, а зараженность грызунов вирусом ГЛПС не превышала 2,2%. В
зоне Закамья показатель заболеваемости населения составил 17,0 на 100 тыс. населения, а инфицированность зверьков вирусом ГЛПС чаще определяется как выраженная эпизоотия (20-40%) [11]. Таким образом, наблюдается корреляция между уровнем заболеваемости ГЛПС в изучаемых зонах и долей инфицированных вирусом PUUV рыжих полевок.

Наибольший показатель заболеваемости населения ГЛПС отмечается в зоне Закамья, что свидетельствует о высоком риске заражения [11]. Обнаруженные значительные различия в инфицированности популяций рыжих полёвок в изучаемых районах РТ требуют дальнейшего расширения исследований на популяции в других местах обитания грызунов трех ландшафтно-географических зон РТ.

Выводы. Установлено, что на территории РТ в различных ландшафтно-географических зонах среди рыжих полевок циркулируют геноварианты вируса PUUV, исследования образцов легочной ткани на содержание хантавирусов TULV и DOBV показали отрицательный результат. Уровень инфицированности рыжей полёвки вирусом PUUV был высоким и составлял в среднем за период наблюдения 14,16+1,81%, варьируя по годам с тенденцией к снижению. Также отмечается вариабельность показателей инфицированности рыжей полевки внутри ландшафтно-географических зон. С целью установления риска заражения населения хантавирусами требуется дальнейшее изучение инфицированности основных носителей ГЛПС в различных ландшафтногеографических зонах (подзонах). Работа выполнена в рамках программы повышения конкурентоспособности Казанского федерального университета и была поддержана госзаданием 20.5175.2017/6.7 Минобрнауки РФ.


Литература
1. Ткаченко Е. А. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом в России – проблема XXI века. / Ткаченко Е. А.// Вест. Рос. Акад. Ест. Наук. - 2012.- № 1.- С. 48-54.
2. Иванова А.В. Эпидемиологическая активность природных очагов геморрагической лихорадки с почечным синдромом на территории Российской Федерации в 2013–2017 гг. и прогноз на 2018 г. / Иванова А.В., Попов Н.В., Пакскина Н.Д., Кузнецов А.А., Матросов А.Н., Шилов М.М., Мочалкин П.А., Корнеев М.Г., Топорков В.П.// Проблемы особо опасных инфекций. -2018. - №1. - С.16-21.
3. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Республике Татарстан в 2017 году: Государственный доклад. Казань: Управление Роспотребнадзора по Республике Татарстан. - 2018. - С. 292.
4. Ступишин А.В. Физико-географическое районирование Среднего Поволжья. /Ступишин А.В. // Казань: Изд-во Казан. ун-та.,1964. - 197 с.
5. Ермолаев О.П. Ландшафтное районирование и картографирование региона Среднего Поволжья. / Ермолаев О.П., Игонин М.Е.// Георесурсы. - 2006. - № 2(19). - С. 20–23.
6. Vapalahti O. Hantavirus infections in Europe. / Vapalahti O. // Lancet Infect. Dis. – 2003. – Vol. 3, No10. – P. 653-661.
7. Garanina S.B. Genetic Diversity and Geographic Distribution of Hantaviruses in Russia. / Garanina S. // Zoonoses Publ. Health. – 2009. – Vol. 56. – P. 297 - 309.
8. Кабве Е. Генетическая характеристика А (L)-сегмента генома вируса Пуумала штамм Казань. / Кабве Е., Давидюк Ю.Н., Хайбуллина С.Ф., Ризванов А.А.// Современная наука: актуальные проблемы и пути их решения. - 2015. - № 8. - С. 51 – 52.
9. 9. Kariwa H. Epidemiological study of hantavirus infection in the Samara Region of European Russia. / Kariwa H. // J. Vet. Med. Sci. – 2009. – Vol. 71, No12. – P. 1569 – 1578.
10. Матросов А.Н. Обзор численности носителей и переносчиков зоонозов, эпизоотической и эпидемиологической обстановки в Приволжском федеральном округе в 2015 г. и прогноз на 2016 г. / Матросов А.Н., Чекашов В.Н., Иванова А.В., Кузнецов А.А. // ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора. - 2016. - С. 21.
11. Шамсутдинов А.Ф. Анализ эпидемиологической обстановки по природноочаговым зооантропонозам в краевой инфекционной патологии РТ. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС). / Шамсутдинов
А.Ф. // Уральский медицинский журнал. -2016. -№ 1(34). - С 72 - 76.

Прочитано 38 раз